ความยาวของการแก้ไขยีนด้วยเทคโนโลยีแบบดั้งเดิมส่วนใหญ่จะน้อยกว่า 5kb และยิ่งส่วนที่แก้ไขนานเท่าไร อัตราความสำเร็จก็จะยิ่งต่ำลงนอกจากนี้ ในการสร้างแบบจำลองเมาส์แบบน็อคอิน/น็อคเอาท์ที่มีชิ้นส่วนยาวโดยใช้เทคนิคแบบดั้งเดิม หนูไคเมอริกจำเป็นต้องได้รับการผสมพันธุ์และคัดกรองเป็นเวลา 2-3 รุ่นเพื่อให้ได้หนูเป้าหมาย และกระบวนการทั้งหมดใช้เวลานานกว่า 10- 12 เดือน.
ข้อดีของการแก้ไขยีนแบบแฟรกเมนต์ยาวอยู่ที่ความสามารถในการเอาชนะข้อจำกัดบางประการของวิธีการแก้ไขยีนแบบดั้งเดิม